Gimė 1963 m. Viekšnių miestelyje, Mažeikių rajone, kur baigė vidurinę mokyklą, vėliau mokėsi Šiaulių universitete ir Lietuvos sporto universitete. Kupiškio rajono Skapiškio vidurinėje mokykloje dirbo mokytoju. 2003-2007 m. ėjo mero pavaduotojo pareigas Kupiškio rajono savivaldybėje, o 2007-2015 m. buvo Kupiškio rajono meru.

Lietuvos valstiečių ir žaliųjų sąjungos narys nuo 1995 m. 2016-2020 m. kadencijoje užėmė LVŽS frakcijos Seime seniūno pavaduotojo pareigas.

2020-2024 m. kadencijoje dirba Nacionalinio saugumo ir gynybos bei Europos reikalų komitetuose. Nuo 2020 m. gruodžio eina Seimo vicepirmininko pareigas.

Pareigos partijoje: LVŽS tarybos narys, Kupiškio r. sk. narys.

Jonas Jarutis išrinktas pagal LVŽS sąrašą daugiamandatėje Seimo rinkimų apygardoje.